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【6h】

圈養(yǎng)華南虎線粒體基因NADH脫氫酶亞基5序列多態(tài)性研究

 

目錄

摘要

第一章引言

第二章圈養(yǎng)華南虎線粒體基因NADH脫氫酶亞基5序列多態(tài)性研究

總結

參考文獻

第三章綜述溯祖理論及中性檢驗

在讀期間發(fā)表的論文

聲明

致謝

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摘要

在現(xiàn)存的五個虎亞種中,華南虎(Panthera tigris amoyensis)是唯一屬于我國特有的虎亞種,目前已幾近野生絕跡,因此圈養(yǎng)華南虎種群成為了該亞種復壯的唯一后備?,F(xiàn)存圈養(yǎng)華南虎的種群基礎數(shù)量很小,僅源于6個野生華南虎奠基者,且自1970年起就再沒有引入野生血統(tǒng)來改良血緣關系,因此近親繁殖始終無可避免,并且會越來越嚴重,從而導致華南虎圈養(yǎng)種群遺傳多樣性不斷減少,使其面臨遺傳衰竭,威脅個體生存和種群繁衍。因此,對華南虎圈養(yǎng)種群遺傳多樣性的調(diào)查和評估成為了一項緊迫的任務。 線粒體DNA作為理想的遺傳標記已被廣泛應用于珍稀瀕危動物的保護生物學和群體遺傳學研究。在線粒體DNA的所有編碼基因中,NADH脫氫酶亞基5(ND5)基因顯示出了相對較高的突變速度,并已被證明適用于對貓科動物進行系統(tǒng)發(fā)育分析及種群遺傳多樣性分析。本研究首次考查了圈養(yǎng)華南虎線粒體ND5基因序列多態(tài)性,從該角度對華南虎圈養(yǎng)種群遺傳多樣性做出評估并提出了相應的圈養(yǎng)管理的建議。 本研究對46只圈養(yǎng)華南虎ND5基因部分片段(345bp)進行測序,僅得到只具一個變異位點(位點172)的兩種單倍型,其中41只華南虎為單倍型Ⅰ(第172位堿基為T),5只為單倍型Ⅱ(第172位堿基為C)。該結果反映出來的單倍型多樣性和核酸多樣性分別為0.198±0.072和0.057%±0.021%,顯示出極低的遺傳多樣性。用Tajima D值進行中性檢驗,獲得了不顯著負值(D=-0.17787),推測其主要原因是該種群近期經(jīng)歷過奠基者效應和隨后的種群擴大。 此外,本研究觀察到明顯的單倍型分布偏向,即單倍型1個體占大多數(shù),其比例約為89%(41/46)。結合華南虎圈養(yǎng)歷史,推斷造成這種單倍型分布偏向的原因主要來自于奠基者單倍型組成、個體繁殖能力的不同以及圈養(yǎng)過程中的人為干預。因此建議在圈養(yǎng)管理中,應注意保護單倍型11個體,并結合譜系制定合理的配種計劃,使單倍型II不至于喪失而導致遺傳多樣性降低加劇。

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