第1 章 緒論
1.1 鱷蜥概況
1.2 鱷蜥分布地點與種群數(shù)量
1.2.1 鱷蜥的分布地點
1.2.2 鱷蜥的種群數(shù)量
1.3 鱷蜥的生存現(xiàn)狀
1.3.1 鱷蜥的野外生存環(huán)境
1.3.2 鱷蜥保護(hù)現(xiàn)狀
1.4 鱷蜥的研究進(jìn)展
1.5 爬行類動物的免疫系統(tǒng)研究進(jìn)展
1.6 爬行動物的兩大免疫基因：MHC和 TLR4基因
1.6.1 MHC基因概述
1.6.2 MHC基因研究進(jìn)展
1.6.3 TLR4基因概況
1.6.4 TLR4基因研究進(jìn)展概述
1.7 鱷蜥免疫基因選擇 MHC與 TLR4 的原因
1.8 研究的目的和意義
1.8.1 研究目的
1.8.2 研究意義
第2 章 鱷蜥的MHC基因初步研究
2.1實驗材料
2.1.1唾液采集
2.1.2 實驗儀器和試劑
2.2 實驗方法
2.2.1 DNA提取
2.2.2 DNA 濃度檢驗
2.2.3 鱷蜥基因組篩選適合擴(kuò)增的 MHC基因
2.2.4 引物設(shè)計
2.2.5 PCR擴(kuò)增和條帶觀察
2.2.6 擴(kuò)增片段序列測序查看與分析
2.2.7 鱷蜥 MHC基因的命名
2.3 結(jié)果
2.3.1 鱷蜥基因組中共篩選出 3個 MHC I 與 3 個 MHCIIβ 基因用于擴(kuò)增
2.3.2 最佳引物篩選結(jié)果
2.3.3 PCR擴(kuò)增條帶圖
2.3.4 序列多態(tài)性分析
2.4 MHC基因研究小結(jié)
第3 章 鱷蜥TLR4 基因初步研究
3.1實驗材料
3.1.1 唾液采集
3.1.2 實驗儀器設(shè)備與試劑
3.2 實驗方法
3.2.1 DNA提取與濃度檢驗
3.3 引物設(shè)計方法
3.4 PCR方法
3.5 數(shù)據(jù)分析與方法
3.5.1 序列測序與校對
3.5.2 鱷蜥 TLR4基因遺傳多樣性指數(shù)分析方法
3.5.3 鱷蜥 TLR4基因單倍型網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建方法
3.5.4 鱷蜥 TLR4基因 SNPs 位點分析方法
3.5.5 氨基酸替換對蛋白質(zhì)影響的方法
3.6 鱷蜥 TLR4 基因研究結(jié)果
3.6.1鱷蜥TLR4基因擴(kuò)增大部分LRR結(jié)構(gòu)
3.6.2 鱷蜥 TLR4基因的遺傳多樣性參數(shù)
3.6.3 鱷蜥 TLR4基因單倍型網(wǎng)絡(luò)圖結(jié)果
3.6.4 鱷蜥 TLR4基因的 SNPs 位點分析
3.6.5 鱷蜥 TLR4突變氨基酸對蛋白質(zhì)影響的預(yù)測
第4 章 討論
4.1鱷蜥經(jīng)典MHC基因缺乏核苷酸多態(tài)性
4.2 鱷蜥 MHC基因位點喪失多態(tài)性的可能原因
4.2.1近交壓力大
4.2.2 物種歷史上的瓶頸效應(yīng)
4.2.3 病原壓力單一
4.2.4 缺乏有效的基因流動
4.2.5 遠(yuǎn)古祖先的基因位點保留
4.3 鱷蜥 MHC基因缺乏核苷酸多態(tài)性將影響生存
4.3.1 抵御疾病能力下降
4.3.2 基于 MHC基因識別配偶無法進(jìn)行
4.4 矛盾的人工繁育策略
4.5 鱷蜥 TLR4 基因遺傳多樣性指數(shù)在鱷蜥各種群間具有差異
4.6 鱷蜥 TLR4 基因單核苷酸多態(tài)性（SNPs）分布特異性顯示不同的病原壓力
4.7 鱷蜥 TLR4 氨基酸位點變異將影響蛋白質(zhì)功能
4.8 MHC基因與 TLR基因在免疫系統(tǒng)相互作用
4.9 鱷蜥保護(hù)政策制定的建議
4.9.1 加強(qiáng)人工庇護(hù)所內(nèi)家系區(qū)分
4.9.2 對鱷蜥進(jìn)行全面的 MHC基因分子背景了解
4.9.3 強(qiáng)力的人工繁育干預(yù)
4.9.4 做好傳統(tǒng)的保護(hù)措施
4.9.5 各保護(hù)區(qū)應(yīng)結(jié)合實情制定重點保護(hù)方向
4.10 不足之處及展望
英文名詞縮寫詞匯
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況
致謝
聲明
廣西師范大學(xué);
