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大腸桿菌基因缺失菌株中碳中心代謝系統(tǒng)的通量平衡分析和通量變異分析

     
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摘要

大腸桿菌(E. coli)因其遺傳信息簡單且容易培養(yǎng)而被廣泛用作各種生物化學(xué)、生物技術(shù)研究等的模式微生物。本文首先通過COBRA工具包構(gòu)建了大腸桿菌碳中心代謝系統(tǒng)的小規(guī)模網(wǎng)絡(luò),然后分別模擬敲除了其中的25種酶,并利用代謝通量平衡分析和代謝通量變異分析研究了基因敲除后的代謝網(wǎng)絡(luò)。通過這些結(jié)果的綜合分析,我們可以推斷大腸桿菌碳中心代謝系統(tǒng)的不同的酶對整個體系的作用。

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