摘要： 為研究黃河三角洲貝殼堤島濱海濕地沉積物微生物遺傳多樣性水平和群落結(jié)構(gòu)特征,應用聚合酶鏈式反應-變性梯度凝膠電泳(Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,PCR-DGGE)技術(shù)檢測該區(qū)域不同樣線沉積物的細菌群落結(jié)構(gòu),對所得DGGE指紋圖譜進行樣品相似性聚類分析和環(huán)境因素主成分分析;對DGGE回收條帶進行克隆測序和BLAST系統(tǒng)發(fā)育分析,并分類、鑒別優(yōu)勢微生物.結(jié)果顯示:貝殼堤島濱海濕地單個樣線上,低潮帶樣品的多樣性指數(shù)(H′)相對較高;同一樣線沉積物的微生物群落結(jié)構(gòu)相似性較高,傾向聚類在一起;優(yōu)勢微生物多數(shù)屬于變形菌門(Proteobacteria)、鞘脂桿菌門(Sphingobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)和海桿菌屬(Marinobacter)等與解磷、降解纖維素、光合產(chǎn)能或石油烴類降解相關(guān)的菌類,也有一定的病原菌分布,絕大部分能夠鑒別到屬,且屬于未培養(yǎng)微生物.

摘要： 現(xiàn)如今,隨著科學技術(shù)水平的不斷提高,微生物標志物已經(jīng)被廣泛地應用于土壤污染生態(tài)毒理學診斷、土壤污染預防和土壤污染的修復效果評價等領(lǐng)域。為了深入研究微生物標志物在土壤污染生態(tài)學中的應用,本文闡述了微生物標志物的概念,詳細介紹常用的土壤酶活性測定方法,并重點研究PCR-DGGE、PLFA等多種新興技術(shù)的應用情況和優(yōu)缺點。在實際工作中,人們應該聯(lián)合應用多種方法,將不同方法與不同技術(shù)的優(yōu)勢融合,以提高評價的準確性與科學性。

摘要： 現(xiàn)如今,隨著科學技術(shù)水平的不斷提高,微生物標志物已經(jīng)被廣泛地應用于土壤污染生態(tài)毒理學診斷、土壤污染預防和土壤污染的修復效果評價等領(lǐng)域.為了深入研究微生物標志物在土壤污染生態(tài)學中的應用,本文闡述了微生物標志物的概念,詳細介紹常用的土壤酶活性測定方法,并重點研究PCR-DGGE、PLFA等多種新興技術(shù)的應用情況和優(yōu)缺點.在實際工作中,人們應該聯(lián)合應用多種方法,將不同方法與不同技術(shù)的優(yōu)勢融合,以提高評價的準確性與科學性.

摘要： 采用聚合酶鏈式反應-變性梯度凝膠電泳(PCR-DGGE)技術(shù)對貴州糍粑辣椒貯藏0～7 d過程中腐敗細菌多樣性變化進行動態(tài)監(jiān)控分析,對樣品的理化指標pH、Aw、總酸、菌落總數(shù)進行測定和感官評定綜合分析.結(jié)果表明:在0～7 d貯藏過程中,各理化指標表現(xiàn)為pH和Aw值呈下降趨勢,菌落總數(shù)和總酸值則顯著升高,感官評定呈逐漸降低趨勢,在第6天達到肉眼可見的腐敗終點.對DGGE圖譜中優(yōu)勢條帶進行鑒定,確定蔥屬菌(Allium monanthum)、未培養(yǎng)的球菌屬(Uncultured Chroococcidiopsis sp.)、蔥屬洋蔥菌(Allium cepa)、關(guān)節(jié)桿菌屬(Arthrobacter sp.)、阿里谷氨酸桿菌(Glutamicibacter arilaitensis)為糍粑辣椒腐敗過程中主要腐敗菌群,其中,潘氏泛酸菌株(Pantoea cypripedii)、節(jié)桿菌(Paenarthrobacter nitroguajacolicus)為糍粑辣椒貯藏過程中的優(yōu)勢腐敗菌.

摘要： 作為影響全球變化的主要因子之一,氮沉降對生態(tài)系統(tǒng)生物地球化學循環(huán)有重要的影響.細菌作為土壤生態(tài)系統(tǒng)物質(zhì)循環(huán)的關(guān)鍵參與者,是土壤生態(tài)系統(tǒng)變化的敏感指標,在氮沉降對生態(tài)系統(tǒng)影響過程中發(fā)揮不可忽視的作用.模擬2種施氮方式(SAN:土表施氮,LAN:葉面施氮)和3種施氮量(5.6、15.6、20.6gN m-2a-1),運用PCR-DGGE技術(shù),分析不同施氮方式和施氮量對兩種盆栽植物馬尾松(Pinus massoniana Lamb.)和木荷(Schima superba Gardn.et Champ.)幼苗土壤細菌多樣性和群落組成的影響.結(jié)果表明:不同氮添加方式下,土壤細菌多樣性和群落組成對氮添加的響應不同,并受到季節(jié)的影響.在雨季,LAN處理木荷土壤細菌多樣性高于SAN處理;而旱季,LAN處理兩種幼苗根系土壤細菌多樣性均高于SAN處理.LAN處理條件下,馬尾松土壤Acidobacteria_Gp1相對豐度在旱季和雨季均顯著高于SAN處理(P＜0.05).在雨季,馬尾松LAN處理土壤Alphaproteobacteria相對豐度顯著低于SAN處理(P＜0.05),旱季沒有顯著差異(P＞0.05).氮添加能夠提高木荷土壤細菌多樣性,提高馬尾松土壤變形菌門的相對豐度.旱季施氮還能夠提高馬尾松土壤Actinobacteria相對豐度,降低木荷土壤酸桿菌門的相對豐度.土壤細菌群落變化與土壤pH顯著相關(guān)(P＜0.05),木荷土壤細菌群落還受到土壤NH4+-N含量的顯著影響(P＜0.05).

摘要： 以草本泥炭為原料進行厭氧發(fā)酵,利用多聚酶鏈式反應(PCR)-變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術(shù)對泥炭發(fā)酵產(chǎn)甲烷過程中古菌群落結(jié)構(gòu)特征進行分析.結(jié)果表明,泥炭發(fā)酵產(chǎn)甲烷過程中古菌菌群均屬于廣古菌門(Euryarchae-ota),包括甲烷鬃菌屬(Methanosaeta)、甲烷繩菌屬(Methanolinea)、甲烷桿菌屬(Methanobacterium)和甲烷短桿菌屬(Methanobrev ibacter),其中甲烷鬃菌屬為優(yōu)勢菌屬;隨著泥炭發(fā)酵產(chǎn)甲烷的進行,甲烷鬃菌屬的相對豐度最高,維持在36.37％ ～50.00％ 之間,甲烷繩菌屬和甲烷桿菌屬的相對豐度分別升至30.00％ 和20.00％,而甲烷短桿菌屬的相對豐度逐漸降低,發(fā)酵末期僅為10.00％;泥炭發(fā)酵產(chǎn)甲烷途徑主要為乙酸營養(yǎng)代謝類型,同時伴隨氫營養(yǎng)代謝類型,不同于以秸稈、牛糞、雞糞、褐煤為原料的產(chǎn)甲烷途徑.該研究表明泥炭發(fā)酵產(chǎn)甲烷過程中存在豐富的古菌菌群,不同發(fā)酵時期的古菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生演替,為促進泥炭生物轉(zhuǎn)化提供了新思路.

摘要： 將城鎮(zhèn)脫水污泥制成5 mm粒徑顆粒分別在15、20、25°C條件下進行蚯蚓堆肥,利用三維熒光(EEM)考察了溫度對蚯蚓堆肥處理城鎮(zhèn)污泥過程腐熟程度的影響,并采用PCR-DGGE技術(shù)探究了不同溫度條件下蚯蚓堆肥微生物種群結(jié)構(gòu)的變化,旨在分析蚯蚓堆肥中的微生物種群結(jié)構(gòu)的變化,進而驗證污泥中腐殖酸類有機物熟化降解機理,并為蚯蚓堆肥處理城鎮(zhèn)污泥實現(xiàn)工業(yè)化生產(chǎn)提供理論依據(jù).EEM分析結(jié)果表明:在堆肥30 d時,堆肥系統(tǒng)中腐殖酸類物質(zhì)已基本降解完全,且隨著堆肥時間的延長,芳香類蛋白質(zhì)一直在被蚯蚓和微生物所利用;同一時期隨溫度升高,蚯蚓吞食和系統(tǒng)內(nèi)的微生物的協(xié)同增效作用能加快系統(tǒng)中DOM的降解效率、提高系統(tǒng)的礦化程度.依據(jù)PCR-DGGE技術(shù)測序結(jié)果可知:蚯蚓堆肥系統(tǒng)中微生物種群對于溫度變化存在緩沖區(qū)間,當溫度在15—20°C范圍內(nèi)變化時,細菌和真核微生物的種群多樣性差異均較小;溫度為25°C時,系統(tǒng)中細菌種群多樣性降低,真核微生物種群多樣性升高;堆肥結(jié)束時,3個溫度組系統(tǒng)中共有細菌種群類別占系統(tǒng)中總細菌種群類別79％以上,共有真核微生物種群類別占系統(tǒng)總真核微生物種群類別75％以上,表明隨著溫度升高系統(tǒng)中主要微生物種群類別并未發(fā)生變化,僅共有微生物種群的相對數(shù)量發(fā)生了改變,且3個溫度組系統(tǒng)中均以擬桿菌門(Bacteroidetes)和子囊菌門(Ascomycota)為優(yōu)勢種群,溫度越高,相對數(shù)量越多,系統(tǒng)中易利用有機質(zhì)所占比重小,系統(tǒng)更加穩(wěn)定.

摘要： [目的]了解不同竹子內(nèi)生固氮菌及其定殖土壤根區(qū)固氮菌的特征和生物多樣性.[方法]以毛竹Phylloslachys edulis、狹葉青苦竹Pleioblastus chino、孝順竹Bambusa multiplex葉部、根部及定植土壤為對象,設(shè)計nifH固氮基因引物,采用聚合酶鏈式反應-變性梯度凝膠電泳(PCR-DGGE)和隨機克隆技術(shù),通過聚類分析、Shannon多樣性指數(shù)分析構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹.[結(jié)果]不同竹子根區(qū)土壤之間、同一竹種根部與葉部之間、不同竹種同一器官之間、根區(qū)土壤與植物之間的固氮菌群落結(jié)構(gòu)差異明顯,同一竹種葉部或根部的重復樣品相似度均不高;根部內(nèi)生固氮菌種類總體多于葉部,土壤固氮菌與根部內(nèi)生固氮菌相似度高于葉部.不同竹種不同器官間固氮菌Shannon多樣性指數(shù)差異顯著,孝順竹葉部(2.73)與土壤(2.70)大于根部(2.53)(P<0.05),狹葉青苦竹根部和毛竹根部大于葉部和土壤(P<0.05).植物樣品隨機克隆測序?qū)Ρ鹊玫?3株固氮菌,僅12株為可培養(yǎng)固氮菌株,分別屬于慢生根瘤菌屬Bradyrhizobium、Dechlorosoma、固氮螺菌屬Azospirillum、腸桿菌屬Enterobacter、Kosakonia、變形桿菌屬Gammaproteobacteria、紅長菌屬Rubrivivax和Azohydromonas.系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果表明:3種竹子內(nèi)生固氮菌明顯不同于其他植物.[結(jié)論]土壤環(huán)境、竹子種類及組織器官均能影響竹子內(nèi)生固氮菌的結(jié)構(gòu)特征和多樣性,定殖于根部的內(nèi)生固氮菌多樣性顯著高于葉部.3種竹子內(nèi)生固氮菌種類與已報道的禾本科Gramineae植物差異顯著.

摘要： 為揭示真空包裝鹽水鵝在4°C、25°C和30°C貯藏溫度下的微生物菌群變化及優(yōu)勢腐敗菌。采用平板計數(shù)法和PCR-DGGE（聚合酶鏈式反應-變性梯度凝膠電泳）技術(shù)對各溫度下不同貯藏期樣品菌落總數(shù)和菌相變化進行分析，并對主要條帶進行割膠測序及同源性比對。結(jié)果表明：菌落總數(shù)在貯藏期逐漸上升，貯藏后期菌落總數(shù)呈下降趨勢；產(chǎn)品貯藏期間的優(yōu)勢腐敗菌主要為耐受極端環(huán)境的芽孢桿菌和類芽孢桿菌、組織菌屬和假單胞菌屬。30°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Tissierllasp.、Virgibacillus pantothenticus 和Paenibacillus larvae；25°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Brevibacillus sp.、Bacillus sp.、Tissierllasp.、Paenibacillussp.和Bacilluslicheniformis。4°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Paenibacillussp.Pseudomonasaeruginosa, 它們可導致產(chǎn)品肉質(zhì)變軟、發(fā)粘、變色并產(chǎn)生異味.

摘要： 為揭示真空包裝鹽水鵝在4°C、25°C和30°C貯藏溫度下的微生物菌群變化及優(yōu)勢腐敗菌。采用平板計數(shù)法和PCR-DGGE（聚合酶鏈式反應-變性梯度凝膠電泳）技術(shù)對各溫度下不同貯藏期樣品菌落總數(shù)和菌相變化進行分析，并對主要條帶進行割膠測序及同源性比對。結(jié)果表明：菌落總數(shù)在貯藏期逐漸上升，貯藏后期菌落總數(shù)呈下降趨勢；產(chǎn)品貯藏期間的優(yōu)勢腐敗菌主要為耐受極端環(huán)境的芽孢桿菌和類芽孢桿菌、組織菌屬和假單胞菌屬。30°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Tissierllasp.、Virgibacillus pantothenticus 和Paenibacillus larvae；25°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Brevibacillus sp.、Bacillus sp.、Tissierllasp.、Paenibacillussp.和Bacilluslicheniformis。4°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Paenibacillussp.Pseudomonasaeruginosa, 它們可導致產(chǎn)品肉質(zhì)變軟、發(fā)粘、變色并產(chǎn)生異味.

摘要： 為揭示真空包裝鹽水鵝在4°C、25°C和30°C貯藏溫度下的微生物菌群變化及優(yōu)勢腐敗菌。采用平板計數(shù)法和PCR-DGGE（聚合酶鏈式反應-變性梯度凝膠電泳）技術(shù)對各溫度下不同貯藏期樣品菌落總數(shù)和菌相變化進行分析，并對主要條帶進行割膠測序及同源性比對。結(jié)果表明：菌落總數(shù)在貯藏期逐漸上升，貯藏后期菌落總數(shù)呈下降趨勢；產(chǎn)品貯藏期間的優(yōu)勢腐敗菌主要為耐受極端環(huán)境的芽孢桿菌和類芽孢桿菌、組織菌屬和假單胞菌屬。30°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Tissierllasp.、Virgibacillus pantothenticus 和Paenibacillus larvae；25°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Brevibacillus sp.、Bacillus sp.、Tissierllasp.、Paenibacillussp.和Bacilluslicheniformis。4°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Paenibacillussp.Pseudomonasaeruginosa, 它們可導致產(chǎn)品肉質(zhì)變軟、發(fā)粘、變色并產(chǎn)生異味.

摘要： 為揭示真空包裝鹽水鵝在4°C、25°C和30°C貯藏溫度下的微生物菌群變化及優(yōu)勢腐敗菌。采用平板計數(shù)法和PCR-DGGE（聚合酶鏈式反應-變性梯度凝膠電泳）技術(shù)對各溫度下不同貯藏期樣品菌落總數(shù)和菌相變化進行分析，并對主要條帶進行割膠測序及同源性比對。結(jié)果表明：菌落總數(shù)在貯藏期逐漸上升，貯藏后期菌落總數(shù)呈下降趨勢；產(chǎn)品貯藏期間的優(yōu)勢腐敗菌主要為耐受極端環(huán)境的芽孢桿菌和類芽孢桿菌、組織菌屬和假單胞菌屬。30°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Tissierllasp.、Virgibacillus pantothenticus 和Paenibacillus larvae；25°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Brevibacillus sp.、Bacillus sp.、Tissierllasp.、Paenibacillussp.和Bacilluslicheniformis。4°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Paenibacillussp.Pseudomonasaeruginosa, 它們可導致產(chǎn)品肉質(zhì)變軟、發(fā)粘、變色并產(chǎn)生異味.

摘要： 為揭示真空包裝鹽水鵝在4°C、25°C和30°C貯藏溫度下的微生物菌群變化及優(yōu)勢腐敗菌。采用平板計數(shù)法和PCR-DGGE（聚合酶鏈式反應-變性梯度凝膠電泳）技術(shù)對各溫度下不同貯藏期樣品菌落總數(shù)和菌相變化進行分析，并對主要條帶進行割膠測序及同源性比對。結(jié)果表明：菌落總數(shù)在貯藏期逐漸上升，貯藏后期菌落總數(shù)呈下降趨勢；產(chǎn)品貯藏期間的優(yōu)勢腐敗菌主要為耐受極端環(huán)境的芽孢桿菌和類芽孢桿菌、組織菌屬和假單胞菌屬。30°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Tissierllasp.、Virgibacillus pantothenticus 和Paenibacillus larvae；25°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Brevibacillus sp.、Bacillus sp.、Tissierllasp.、Paenibacillussp.和Bacilluslicheniformis。4°C下主要優(yōu)勢腐敗菌為：Paenibacillussp.Pseudomonasaeruginosa, 它們可導致產(chǎn)品肉質(zhì)變軟、發(fā)粘、變色并產(chǎn)生異味.

摘要： 利用PCR-DGGE方法分析了含水量和添加有機物料腐熟劑對土壤細菌群落變化的影響。結(jié)果表明,土壤細菌的種類和數(shù)量受到含水量和有機物料腐熟劑的明顯影響。0-30天,土壤中菌群數(shù)量和種類呈上升趨勢;30-50天,土壤菌群基本保持穩(wěn)定,60天開始下降。土壤含水量為80％,腐熟劑添加量為0.2g/kg時對土壤菌群數(shù)量和種類影響最為明顯。